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中心为确保研发能力始终站在国内外玉米育种与高产栽培技术前沿，坚持走高起点产学研联合的路子，加强与知名院校、研发机构的合作，全方位整合国内科技资源。
中心与中国农业大学、山东大学、山东农业大学、中国农业科学院、北京市农林科学院、山东省农科院等16所高等院校和科研单位开展了四种类型的合作关系。一是合作成立人才培养基地，2009年5月7日山东省教育厅、山东省人民政府学位委员会联合行文将中心确定为"第一批山东省研究生联合培养基地"。2010年，中心与青岛农业大学的研究生联合培养工作已全面展开。二是为大专院校提供科研平台，成为中国农业大学和山东农业大学的玉米高产栽培研究基地，山东省农科院玉米所和青岛农业大学的玉米品种试验基地，中国农科院生物技术所和山东大学的转基因育种和基地。三是成为大专院校的教学实习基地，中心承担山东农业大学、青岛农业大学等高等院校的教学实习任务。四是联合申报承担科研项目。近年来，与中国农业大学、中国农业科学院、山东农业大学、山东大学、青岛农业大学等单位合作开展转基因、分子标记、细胞工程和高产玉米栽培研究工作，联合承担16项国家课题并取得成果。
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